Markopulos je decenijama bio jedna od najcenjenijih figura grčke košarke, a tokom duge trenerske karijere vodio je sva tri velika kluba iz rodnog Soluna – PAOK, Aris i Iraklis.
Radio je i u Makedonikosu, kao i u atinskim klubovima AEK-u i Marusiju.
Najveći uspeh ostvario je 1994. godine, kada je tokom sezone preuzeo PAOK i odveo ga do trofeja u FIBA Korać kupu. Solunski klub je u finalu, igranom u dve utakmice, bio bolji od Stefanel Trsta.
Markopulos je dva puta proglašavan za trenera godine u Grčkoj, a uvršten je i u Kuću slavnih grčke košarke. Ostao je rekorder po broju utakmica na klupi u najvišem rangu grčke košarke, sa više od 700 vođenih mečeva.
Bio je poznat kao veliki košarkaški učitelj i trener koji je ostavio trag na brojne generacije igrača, a njegovim putem krenuo je i sin Haris Markopulos, nekadašnji košarkaš, a potom i trener.
